밸류 챌린지 글을 읽다가 일루미나 분석글이 있어서, 첨언을 달았는데...
블로그에 옮겨 봅니다.
좋은 분석글 감사합니다. 연구자의 입장에서 첨언을 하고 싶어서 댓글을 달아봅니다.
저는 Genomics/Bioinformatics 분야에 박사학위가 있고, 실제 genome project에 다수 참여한 경험이 있습니다. 한국 최초로 BGI 기기의 테스트 드라이브 연구에 참여하였고, ONT Tech Day Seoul에 연자로 참여한 경험이 있으며, PACB사의 Sequel2 HiFi 기술을 활용하여 한국인 유전체 지도 제작 프로젝트를 진행한 경험이 있습니다.
해당 분야의 전문가 입장에서 말씀을 드리자면, Illumina는 이미 시장을 점유해버렸고, short-read sequencing 분야에서 기술적으로 정점에 도달했습니다. BGI가 도전적인 자리에 있긴 합니다만, 기술적으로 아직(하드웨어적 & 케미컬적으로) Illumina를 따라잡지 못하고 있습니다. 기술적으로 Illumina는 생산성 확대를 제외하고는 큰 발전이 없는 상태입니다. Illmunia의 최신 sequencer들도 특별한 장점을 가지고 있지 못하고, chemical 안정성만 더 나아지는 추세구요. long-read sequencing 분야는 도전했다가 PACB와 ONT로 인해 쓴 잔을 마셨습니다.
재밌는 것은 이러한 정체는 Illumina만의 것이 아닙니다. PACB도 Sequel-2 HiFi sequencing 기술을 개발한 이후, 더 이상의 발전이 없다고해도 과언이 없는 상황입니다. 그리고 이 두 업체의 정점인 시점에 T2T complete human genome project의 결과물이 나왔습니다. 우연이라고 하기엔 좀 재밌는 상황이죠. 그간 sequencing 업체들, 특히 long-read sequencing 업체들은 완벽한 인간 유전체 지도를 완성하기 위해 노력해왔습니다. short-read sequencing 기술로 도달하기 힘든 telomere와 centromere 영역의 완벽한 조립을 위해서는 특별한 기술이 필요할 것이라 생각했기 때문이죠. 그러나 T2T팀이 다양한 기술의 조합으로 이 한계를 넘어섰습니다. 기존의 기술로도 충분히 가능하다는 것을 보여줬죠. 그리고 네이쳐 저널에 해당 ...
